水蚀凹槽是潜水、暗河、地表河流、湖等水体侧向溶蚀岩壁上节理、裂隙密集部位抗风化和流水侵蚀能力较低的碳酸盐岩而形成的内凹体，沿水平方向展布，横截面呈横U形，是水体对岩石的溶蚀结果。水蚀凹槽代表了古水位线。在杨家川峡谷两侧线状分布着水蚀凹槽，凹槽大小不一，长度0.5-1米，高0.4-0.7米，深度约0.3米，深度小于槽口高度，由下至上呈3级分布。峡谷两壁不同部位发育侧蚀凹槽说明地壳属于间歇性、阶段性持续抬升，没有发生强烈的褶皱运动和差异性掀斜性升降。